Presentado como una escena en retrospectiva, The Last Mimzy es la historia de un futuro lejano que intenta encontrar una solución, a través de los viajes en el tiempo, a la catastrófe ecológica que ha destruido su mundo.
Emma desarrolla una fuerte conexión emocional con Mimzy, asegurando incluso poder oírla hablar o entablar conversaciones con ella para, entre otras cosas, aprender cómo seguir manipulando los dispositivos.
Mimzy parece traer un mensaje enviado desde el futuro de la humanidad, donde la contaminación ha destruido casi el mundo entero.
Mimzy explica a los niños que deben utilizar los juguetes como si fuesen una máquina del tiempo para volver a su futuro con alguna muestra de su ADN, para que la gente del futuro lo pueda utilizar para corregir una mutación mortal en su propio ADN causado por los problemas ecológicos.
Afortunadamente, Mimzy lleva consigo una lágrima de Emma, que contiene en su ADN la pureza necesaria para evitar el desastre del futuro.