Fundada en 1988 por los editores Thomas Frank y Keith White, tuvo su sede en Chicago, Illinois, hasta 2010, cuando se trasladó a Cambridge, Massachusetts.

En 2011, The Baffler trasladó su sede a Cambridge y John Summers asumió el cargo de editor.

La revista firmó un contrato editorial con MIT Press y, tras otro rediseño, comenzó a publicarse tres veces al año.

En 2019, Lehmann partió hacia The New Republic y Jonathon Sturgeon se convirtió en editor en jefe.

[13]​ En 2017, The Baffler y CTXT, una publicación online independiente española, iniciaron un acuerdo editorial colaborativo.