Debido a los terremotos acontecidos entre 1580 y 1616 en la ciudad, esta pequeña iglesia se fue deteriorando; por lo que a principio del siglo XVII ya este lugar se encontraba en el olvido y el abandono de los fieles, así que se decidió destruirla.Lastimosamente su diseño original con elementos mozárabes se ha ido perdiendo debido a terremotos.El color púrpura violeta significa majestuosidad, magnanimidad, dominio, solemnidad, solidez, grandeza, perennidad y fortaleza.El color rojo o gule significa amor, sentimiento, pasión, coraje, tenacidad, libertad, espiritualidad, fidelidad, fraternidad, lealtad, celo, valentía, entrega, atrevimiento y osadía.El esmalte plata o blanco significa pureza, nitidez, gallardía, humanismo, paz, tolerancia y generosidad.
La iglesia San Juan, en el fondo las torres de la catedral
