La especie es de las regiones montañosas mayas de Chiapas, México y Guatemala, donde crece en condiciones hídricas y tierras arcillosas ácidas con exposición del sol lleno y a temperaturas frías que van de - 17 a 4,5 °C.

Es una especie utilizada en San Cristóbal de las Casas, Chiapas, México, porque los indígenas de esa región la han utilizado tradicionalmente para el tratamiento empírico de las diarreas, dolor de cabeza y fiebre, por lo cual los pobladores la han adoptado como una planta medicinal.

[1]​ Tagetes nelsonii fue descrita por Jesse More Greenman y publicado en Proceedings of the American Academy of Arts and Sciences 39(5): 117.

[2]​ Tagetes: nombre genérico que proviene de la mitología etrusca Tages.

[3]​ nelsonii: epíteto otorgado en honor de David Nelson.