[4] A la edad de 15 años se encontró con Bhagavan Nityananda, un avadhut errante que cambió su vida profundamente.[6] Después de que Siddharudha dejó su cuerpo, Swami Muktananda fue a estudiar con un discípulo de Siddharudha llamó Muppinarya Swami en el Sri Airani Holematt en el distrito Ranebennur Haveri.[7] Muktananda pasó los siguientes nueve años viviendo y meditando en una pequeña cabaña en Yeola.[8] En mayo de 1982, Muktananda nombró a dos sucesores como líderes de Siddha Yoga, Swami Chidvilasananda y su hermano más joven, Swami Nityananda quién más tarde formó su propio grupo.Muktananda a menudo daba una versión más breve: "Dios mora en ti como tú mismo"[10].Según Lola Williamson, Muktananda fue conocido como "shaktipat gurú porque en su presencia el despertar de kundalini ocurría muy fácilmente".[12] Históricamente, la iniciación Shaktipat ha sido reservada para los pocos que habían hecho muchos años de prácticas espirituales y servicio; Muktananda ofreció esta iniciación tanto a recién llegados como a yoguis.[14] En Gurus of Modern Yoga, Andrea Jain, en su capítulo en Muktananda, cita una fuente anónima, quién describe el momento de su shaktipat, cuando tenía 19 años, conferido por Muktananda con un plumero de plumas de pavo real en 1975.Di un salto cuando, con firmeza pero con suavidad, las plumas de pavo real me golpearon repetidamente en la cabeza y luego suavemente rozaron mi cara mientras [Muktananda] [...] presionaba con fuerza uno de sus dedos en mi frente en el entrecejo [...] Sinceramente, soy reacio a escribir sobre lo que sucedió después porque cualquier cosa que diga lo disminuirá inevitablemente, lo hará sonar como si fuera simplemente otra "experiencia poderosa".
