Le corresponde al Presidente del Supremo Tribunal de Justicia ejercer las atribuciones administrativas y financieras.
El año 2013 fue elegido presidente António Henriques Gaspar.
Los orígenes del Supremo Tribunal de Justicia, se encuentran en los tribunales superiores de la Corte (cuya cúspide era el propio Tribunal de la Corte), instalados durante siglos en la residencia oficial del monarca.
La Constitución Política de la Monarquía Portuguesa decretada por las cortes generales extraordinarias y constituyentes, reunidas en Lisboa en el año de 1821, proclamó la separación de poderes y confirió el ejercicio del poder judicial exclusivamente a los jueces, abriendo camino para la reforma del sistema de administración de justicia que está en vigor desde entonces.
Sin embargo, los problemas derivados de la Revolución Liberal provocaron que su efectiva instalación se viera dilatada; finalmente, gracias a José da Silva Carvalho, que era Ministro de Justicia y que se convirtió en el primer presidente del Supremo Tribunal de Justicia, se instaló el 14 de septiembre de 1833.