Se rige por un estatuto orgánico contenido en el Decreto con Fuerza de Ley N° 101 de 1980, del Ministerio del Trabajo y Previsión Social.

En la práctica regula los tres pilares de la nueva ley: el pilar contributivo (Administradoras de Fondos de Pensiones - AFP), solidario (Ahorro Previsional Voluntario - APV) y voluntario (Ahorro Previsional Voluntario Colectivo - APVC).

Como organismo autónomo, su máxima autoridad es el Superintendente, el cual es designado por el presidente de la República.

Se relaciona con el Gobierno a través del Ministerio del Trabajo y Previsión Social, por intermedio de la Subsecretaría de Previsión Social.

Su primera titular fue Solange Berstein (2008-2010;-2014), quien fue sucedida por Tamara Agnic (2014-2016) y esta, por Osvaldo Macías (2016-presente).