En 1988, Katanec se unió al VfB Stuttgart en la Bundesliga alemana.

En 1994, también ganó la Copa Italia con la Sampdoria bajo la dirección de Sven-Göran Eriksson.

Katanec jugó cinco partidos más (y marcó un gol) para la selección nacional de fútbol de Eslovenia, pero apareció en sólo un partido oficial.

Poco después expiró su contrato con la Sampdoria y terminó su carrera futbolística.

[2]​ Clasificó al equipo a la Eurocopa 2000[3]​, donde Eslovenia cayó en primera ronda, y, principalmente, la llevó a la Copa Mundial de Fútbol de 2002, pero, esta vez, el equipo jugó mal, quedando sin puntos al caer contra España, Sudáfrica y Paraguay.

[4]​ Katanec tuvo un enfrentamiento con el futbolista Zlatko Zahovic, en el cual el futbolista insultó a Katanec por haberlo sustituido en la derrota ante España en el primer partido, motivo por el cual Zahovic fue expulsado del torneo y Srecko anunció que después del Mundial dejaría de dirigir a Eslovenia.

[15]​ Su primera gran competición fue la Copa Asiática 2019, donde consiguió lo que había fracasado con Eslovenia y los Emiratos Árabes Unidos, al llegar por primera vez a los octavos de final en un gran torneo, ya que Irak alcanzó los octavos de final antes de perder ante los eventuales campeones Catar por 1-0.