El Southern District desde 2002 ingresó a la recién formada Tercera División del Distrito de Hong Kong.

En la temporada 2006-07, llegaron a la ronda final por primera vez desde que se formó el club.

Fueron subcampeones de la Tercera División Distrital y clasificaron a la Ronda Final, sin embargo, no pudieron ascender, ya que solo lograron sumar dos puntos.

En la temporada 2008-09, no pudieron clasificarse para la ronda final ya que solo se ubicaron en el cuarto lugar de la Tercera División del Distrito.

Finalmente fueron ascendidos a la Segunda División de Hong Kong por primera vez en la temporada 2009-10.