Los hermanos Ramón y Felipe Herrero, propietarios de la tienda El Siglo Nuevo en San José, fueron sus principales dirigentes.
También fue el primer club en desarrollar una gira internacional en Guatemala donde ganó los tres partidos contra la Selección Mayor, B y C de ese país.
Posteriormente, en 1969, descendió al torneo de las canchas abiertas para despedirse en definitiva del fútbol organizado.
Entre 1975 y 1976 tuvo un corto regreso a la Segunda, solo para desaparecer al cierre de esa temporada.
Gimnástica se extinguió como asociación deportiva en 2005, ya que su junta directiva no fue renovada dentro del año siguiente a su vencimiento.