La especie tipo fue descrita por primera vez en 1995 como un nombre genérico para sustitución Leptosuchus gregorii.

[1]​ Debido a la gran cresta rostral que poseía, se considera que es lo suficientemente distinta de otras especies de Leptosuchus (todos los cuales tenían más pequeño y más restringido crestas) para estar dentro de su propio género.

[2]​ sin embargo, estudios más recientes apoyan la idea de que Smilosuchus es distinta de la especie tipo del Leptosuchus , Leptosuchus crosbiensis .

Los análisis filogenéticos sugieren que Smilosuchus es relacionado con más de cerca pseudopalatine.

[3]​ A continuación se muestra un cladograma de Stocker (2012):