Durante una crisis nerviosa, al ver en su hijo la parte heredada de su padre, lo atacó.
[6] En su segundo traje, usa una chaqueta azul oscuro, pantalones a juego, una camisa de combate plateada y botas blancas.
Aunque es bastante brutal, demuestra estar firmemente plantado en la ética del heroísmo, sólo deseando someter a sus enemigos sin querer matarlos.
Su pesadilla comienza desde los cinco años cuando su padre lo somete a un entrenamiento muy duro para un niño de su edad, algo con lo que su madre no está a favor y en respuesta, Enji la maltrata cruelmente provocándole daños psicológicos que traerían consecuencias desastrosas años más tarde.
Shoto aparece por primera vez en el sexto capítulo del manga como un estudiante de la Academia U.A.
Comienza a desarrollar una fuerte amistad con Midoriya, suficiente para acudir en su ayuda durante la batalla contra Stain.
[20] Durante los exámenes tiene la oportunidad de hablar con su padre Endeavor, quien quiere acercarse a la familia e intentar ser mejor ante sus ojos.
Shoto luego decide adoptar una actitud cautelosa hacia él, conociendo la vieja naturaleza de su padre, pero se revela preocupado y asustado cuando lo ve enfrentarse a un nuevo Nomu, solo para regocijarse al verlo vivo y victorioso.
[22] En una campaña colaborativa entre My Hero Academia y Avengers: Infinity War, los personajes del anime comentan sobre los vengadores que se les asignaron con Shoto hablando sobre Thor.