La Temporada 1989-90 de la Segunda División de México fue el XLI torneo de la historia de la segunda categoría del fútbol mexicano.

El Club León se proclamó campeón por primera ocasión tras vencer al Inter de Tijuana en la final por el título.

Los veinte equipos se dividen en cinco grupos de cuatro clubes, manteniendo los juegos entre los 20 en formato de todos contra todos a visita recíproca en 38 jornadas.

Los dos primeros lugares de cada agrupación se clasifican a la liguilla en donde los ocho clubes se reparten en dos grupos de cuatro conjuntos, siendo los líderes los que jugarán la final por el campeonato a visita recíproca.

Los últimos tres lugares de la tabla general descenderán a Segunda B.