Se estableció una clasificación con arreglo a los puntos obtenidos en cada enfrentamiento, a razón de dos por partido ganado, uno por empatado y ninguno en caso de derrota.

Se aplicaron los mismos criterios de puntuación que en la primera fase.

Los dos primeros clasificados al término de las seis jornadas lograron el ascenso a Primera División para la próxima temporada, mientras que los otros dos equipos restantes jugaron una promoción a partido único en campo neutral frente a los dos últimos clasificados de Primera División.

CD Alavés, Alicante CF, Burjasot FC, SD Ceuta, Constancia FC, Elche CF, Erandio Club, AD Ferroviaria, CD Granollers, Imperial CF, Imperio CF, CD Mallorca, Recreativo Ónuba, RD Oriamendi, Sestao SC, EHA Tánger y Deportivo Torrelavega descienden a Tercera División.

Fuente: BDFutbolCriterios de clasificación: Puntos · Diferencia de goles · Goles a favor · Play-off Fuente: BDFutbolCriterios de clasificación: Puntos · Diferencia de goles · Goles a favor · Play-off Fuente: BDFutbolLa promoción se jugó a partido único en Madrid, con los siguientes resultados: Campeón de Segunda División: Ascienden a Primera División: Descienden a Tercera división: