[2]​ Durante su primera etapa (2006-2010), la Secretaría de Estado estuvo compuesta de dos órganos directivos: la Dirección General de Política Exterior para Iberoamérica y la Dirección General de Organismos Multilaterales Iberoamericanos.

[4]​ Apenas año y medio después, en diciembre de 2011, el nuevo ministro de Exteriores, José Manuel García-Margallo, recuperó este órgano superior con un único órgano directivo, la Dirección General de Política Exterior que desde finales de 2010 se denominó Dirección General para Iberoamérica.

[5]​ Este cambio apenas duró unos días y no se llegó a nombrar un titular, puesto que en enero de 2012 se suprimió y se integraron sus funciones en la Secretaría de Estado de Cooperación Internacional.

[6]​ No será hasta julio de 2021, bajo el mandato del ministro José Manuel Albares, que estas funciones volverán a tener una Secretaría de Estado propia.

Durante los casi diez años que estas competencias estuvieron en otras Secretarías de Estado, sus órganos cambiaron de denominación para «impulsar las relaciones con el área del Caribe»;[7]​ así, la Secretaría de Estado se recuperó bajo la denominación de Secretaría de Estado para Iberoamérica y el Caribe y el Español en el Mundo y se compuso de dos órganos directivos: la Dirección General para Iberoamérica y el Caribe y la Dirección General del Español en el Mundo.