Sebastián de Lartaun (*Oyarzun (Guipúzcoa), 15??
- † Lima, 1583) fue un eclesiástico español, quien llegó a ser Obispo del Cuzco.
Se opuso asimismo, a la erección de la diócesis de Arequipa, que debía desprenderse de la del Cuzco en atención a lo solicitado por su antecesor en la sede, fray Juan Solano.
Durante el III Concilio Limense (1582) se enfrentó a las recriminaciones del arzobispo Toribio de Mogrovejo; pero lejos de aceptarlas y moderar sus exigencias de rentas y pensiones, llegó incluso a promover alborotos mediante gente armada.
Durante su estancia en Lima, tras una breve y sorpresiva enfermedad, falleció el obispo Lartaún.