Allí fundó en 1967 la banda de rock the Stooges junto a su hermano Ron Asheton, Iggy Pop y Dave Alexander.

Con la formación original de la banda grabó dos álbumes,The Stooges en 1969 y Fun House en 1970, para Elektra Records.

Tras algunos cambios en la formación, la banda grabó un tercer disco en 1973 Raw Power, esta vez con Columbia Records, antes de disolverse definitivamente al año siguiente.

[3]​ Grabó cuatro álbumes con Sonny Vincent, tocando la batería junto al bajista Captain Sensible.

Tras la muerte de su hermano Ron en 2009, la banda recuperó al guitarrista James Williamson.