Es conocido por su Batalla de Flores, en la que también se realiza el reinado intermunicipal y departamental del Atlántico.
Fundado a principios del siglo XVIII por Francisco y Miguel Becerra en un asentamiento ribereño de fértiles tierras, fue declarado municipio en el año 1857.
Otros productos importantes para el sector agrícola del municipio son la yuca y el maíz.
La hidrografía del municipio le brinda un escenario potencial para la producción y explotación pesquera, sin embargo el número de personas que se dedica a esta actividad es muy reducido.
Santo Tomás es la cuna del Porro Negro, género folclórico autóctono y pieza imprescindible de las festividades carnestoléndicas.