El clima (según la clasificación de Koeppen) es del tipo Cb(w2)(w)(i`)g : templado subhúmedo con lluvias en verano.

Los meses más calurosos son mayo y junio con una temperatura promedio de 20 °C.

Los meses más fríos son diciembre y enero con una temperatura media de 13 °C.

Las especies de plantas más representativas son el sauce (Salix sp.

Gran parte del territorio está dedicado a terrenos agrícolas.

La fauna representativa de la localidad es poca y se incluyen conejos, liebres, ardillas, coyotes, zarigüeyas, armadillos, serpientes, tortugas, lagartijas y diversas especies de aves.

En la relación de Necotlán, se narra que el líder de este pueblo, llamado Ocelhuapanzin, recibió del irecha Purépecha Tzitzipandácuare permiso para poblar la frontera oriente del imperio Tarasco, estableciéndose en cuatro asentamientos principales: Matlatzingo (Charo), Sant María de los Altos, Necotlán y Huetamo.

El establecimiento del convento en el pueblo se realizó, entre otros aspectos, con el fin de superar la dificultad que tenían los indígenas para acudir cada domingo a la ciudad de Valladolid para recibir los sacramentos.

Esta región permitió a los mendicantes el aprovechamiento de la agricultura en el valle conformado por el río Grande y sus afluentes.

En las inmediaciones del pueblo surgieron desde el siglo XVI importantes haciendas que funcionaron hasta principios del siglo XX destacando las haciendas de Tirio, Santa Rosalía y la Estancia.

De ellas, el 98,64% cuentan con electricidad, el 92,39% tienen agua entubada, el 95,65% tiene excusado o sanitario, el 83,70% radio, el 97,55% televisión, el 85,33% refrigerador, el 66,30% lavadora, el 45,11% automóvil, el 12,77% una computadora personal, el 36,14% teléfono fijo, el 65,22% teléfono celular, y el 1,90% Internet.

Predomina el cultivo de maíz, pero también se produce jitomate, arándano y aguacate.

Una pequeña parte de la población se dedica la explotación forestal, incluyendo madera y resina.