Ya en Universitario de Deportes, junto con José Luis Carranza y José Guillermo Del Solar «Chemo» y con la dirección técnica de Ángel Cappa, poco a poco, se afianzó como titular.

Aun teniendo grandes problemas económicos, con el equipo consiguió el primer título de su carrera: el Torneo Apertura.

Al año siguiente, fichó por Cienciano, un club emergente del fútbol peruano.

el 10 de septiembre de 2004 es presentado como nuevo jugador del UD Almería, afianzándose como titular indiscutible durante toda la temporada, en la temporada 2006-2007 se da el sueño de volver a la primera división de la liga española en donde Santiago Acasiete fue pieza fundamental del equipo que logra el ascenso a la máxima división del fútbol español, ya en primera división Acasiete cumple grandes partidos ante los grandes equipos de España como ante el Real Madrid en el mismo Santiago Bernabéu, y también ante equipos como FC Barcelona o el Valencia CF, se afianzó como titular indiscutible y capitán del Almería durante varias temporadas.

En el Almería, club en el cual ha jugado muchos años, la gran parte en la Primera División Española, y la otra en la Segunda División, se ha ganado el respeto y cariño de muchos fanes del Club, siendo uno de sus jugadores más reconocidos.