San Francisco de Wayo es un poblado indígena warao en el Delta Amacuro, Venezuela.

[1]​ El poblado tiene una misión católica, la misión San Francisco de Wayo (o Guayo), fundada por el padre y lingüista Barral.

La mayor parte del pueblo está compuesto por palafitos.

El acceso al poblado solo es posible en bote o con hidroaviones.

En 1942 el misionero capuchino Barral estableció una base allí.