São Sebastião es una freguesia portuguesa perteneciente al municipio de Ponta Delgada, situado en la Isla de São Miguel, Región Autónoma de Azores.
Posee un área de 3,20 km² y una población total de 4 309 habitantes (2001).
La densidad poblacional asciende a 1 346,6 hab/km².
Se encuentra a una latitud de 37ºN y una longitud 25ºO.
La freguesia se encuentra a 1 m s. n. m. Hasta el 20 de junio de 2003, su designación oficial era Matriz.