La siguiente campaña, en Segunda División, logró hacerse un hueco en el primer equipo, contribuyendo al ascenso de categoría.
Roberto disputó 31 partidos de liga, aunque prácticamente siempre como suplente, y anotó tres goles.
Su aportación se redujo la siguiente campaña, con 27 partidos de liga, pero solo ocho como titular, y dos goles.
[2] En su regreso al club rojiblanco, la temporada 1998/99, logró hacerse de nuevo un hueco en el once titular, disputando treinta partidos y anotando cuatro dianas.
Su buena campaña en Salamanca le abrió las puertas para volver a Primera, firmando con el Real Murcia tras rescindir su contrato con el Atlético de Madrid.