[1]​ Heschl estudió en la Universidad de Viena, en la cual recibió su doctorado en 1849.

En 1850 se convirtió en primer asistente de Carl von Rokitansky.

En 1854 trabajó como profesor de anatomía en el instituto médico quirúrgico de Olomouc, y en 1855 trabajo como profesor de Anatomía Patológica en la Universidad Jaguelónica, ubicada en Cracovia.

En 1861 se convirtió en profesor en el instituto médico-quirúrgico de Graz, en donde posteriormente, en 1863, fue nombrado profesor titular de anatomía.

Después de su muerte, los giros temporales transversos (ubicados en la corteza auditiva primaria) fueron nombrados como giros de Heschl en su honor.