Cuando Freeborn Garrettson visitó la plantación para predicar, el dueño de Allen se sintió conmovido y comenzó a considerar la idea de que tener esclavos era pecado.
Se convirtió al metodismo a la edad de 17 años, En 1784, Allen fue calificado como predicador y participó en la fundación de la Iglesia Metodista en América del Norte en Baltimore, Maryland.
La discriminación racial lo obligó a renunciar en 1787 y se volvió herrero dentro de la primera iglesia para negros en EE. UU.
Los temas sociales de la predicación del obispo Allen fueron la abolición, la colonización, la educación y la templanza.
[3][4] Trabajó para mejorar el estatus social de la comunidad negra, organizando escuelas sabáticas para enseñar alfabetización y promoviendo organizaciones nacionales para desarrollar estrategias políticas.