El yacimiento de Rhynie es considerado un Lagerstätte, un yacimiento en el que es posible encontrar un ecosistema casi completo e in situ gracias a la acción de agentes naturales que garantizaron su conservación, en este caso gracias a los sedimentos acumulados por la acción de manantiales ricos en sílice que se acumularon sobre las estructuras.Fue descubierto en 1912 cuando William Mackie se encontraba realizando estudios geológicos en la zona;[3] los primeros trabajos desarrollados por Robert Kidston y William Henry Lang entre 1917 y 1921 pusieron de manifiesto la naturaleza peculiar del Lagerstätte.[5] Son muchas las estructuras encontradas en Rhynie Chert que han sido identificadas como formadas por la actividad de cianobacterias, pero solo unas cuantas han podido ser determinadas al existir pruebas inequívocas de su naturaleza.[12] Se ha identificado como liquen en Rhynie a la especie Winfrenatia reticulata que forma talos laminares de bordes irregulares.En la superficie de esta el micobionte, que no ha podido ser identificado, forma depresiones limitadas por crestas en cuyo fondo se situaba una cianobacteria cocoidea asociada a las hifas fúngicas.[13][14][15] Las clorofilas son un grupo con un registro fósil bastante conocido, destacan los acritarcos del yacimiento de Ediacara.En Rhynie las dos especies descubiertas, Mackiella rotunda y Rhynchertia punctata comparten estructura filamentosa y presencia de cuerpos extraños en el interior de sus células que han sido identificados como estructuras reproductoras.Palaeonitella cranii tiene una estructura similar a las carofitas conocidas en la actualidad con un talo acuático erecto ramificado verticiladamente en los nudos.Se deduce de las muestras que la planta poseía un rizoma horizontal y tallos erectos.El esporangio era similar a Rhynia pero poseía una columela central que se continuaba con el floema del tallo.[24] Otras especies presentes de estructura similar a las anteriores son Trichopherophyton teuchansii, Ventarura lyonii o Nothia aphylla.
Representación de las seis plantas terrestres presentes en Rhynie Chert.
A.
Rhynia gwynne-vaughanii
B.
Aglaophyton major
C.
Ventarura lyonii
D.
Asteroxylon mackiei
E.
Horneophyton lignieri
F.
Nothia aphylla
.
Sección de un tallo de
Rhynia
, mostrando la estructura de la
estela.