Merino también estuvo involucrado en la crisis política de 2020 cuando 40 soldados fueron enviados a la Asamblea Legislativa durante una sesión extraordinaria convocada por Bukele.

En febrero de 1987 fue transferido a la Escuela Naval Arturo Prat en Valparaíso, Chile, y ya en diciembre de 1990 fue retransferido a la Escuela Militar Capitán General Gerardo Barrios, graduándose finalmente en marzo de 1990.

[3]​ Fue elegido por el presidente electo Nayib Bukele para ser Ministro de Defensa.

Los abogados argumentaron que su ascenso era ilegal según el artículo 13 de la Ley de la Carrera Militar, pero Merino Monroy defendió su ascenso afirmando que «en el servicio activo soy el más antiguo de las Fuerzas Armadas.

En la Armada somos menos los que obtenemos el grado de Contralmirante».