Rayón fue fundada en 1638, por el Jesuita misionero Pedro Pantoja, quien le dio el nombre de Nuestra Señora del Rosario de Nacameri; la zona había sido habitada por las personas pima pima bajos.

En 1850 se le dio la categoría de villa y en la mitad del siglo XIX fue un municipio perteneciente al distrito de Ures.

A continuación se muestra una tabla con las normales climatológicas de la localidad, registradas por el SMN en el período 1951-2010.

Cuentan con equipo de Beisbol "Los Broncos"[5]​ y un estadio Estadio Alberto "Pelón" Moreno para jugar, y participan en la Liga del Río Sonora.

Ninguna La ciudad de Rayón está hermanada con 3 ciudades alrededor del mundo: