El Rally de Madrid de 1999, oficialmente 16.º Rallye de Madrid, fue la decimosexta edición y la duodécima cita de la temporada 1999 del Campeonato de España de Rally.

Fue también puntuable para el campeonato de Madrid, el campeonato de Extremadura, el Desafío Peugeot, la Copa Ibiza y la Copa Saxo.

Se celebró del 26 al 27 de noviembre y contó con un itinerario de catorce tramos que sumaban un total de 148,7 km cronometrados.

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