Es navegable para embarcaciones comerciales y de recreo.

[1]​ El río Yonne tiene una longitud de 292,3 km y una cuenca que se extiende por 10.836 km².

[3]​ En su desembocadura el Yonne aporta un caudal promedio superior al del Sena.

El Yonne nace en la montaña Prénely en el lado sur del Macizo del Morvan en la comuna Glux-en-Glenne, departamento de Nièvre, a unos 738 m de altitud.

[4]​ El Yonne fluye, de manera general, del sureste hacia el noroeste pasando a través de 115 comunas, la mayoría de ellas en Borgoña; las principales comunas son:[2]​ Finalmente, desemboca en el Sena en Montereau-Fault-Yonne (Sena y Marne), a una altitud de 47 m.[5]​ Los principales afluentes del Yonne are: