Fluye un corto tramo en dirección norte para dar una amplia vuelta y dirigirse al sur a través de Madhya Pradesh y corre 98 km, con una anchura media de unos 250 m, hasta que se le une el río Thanwar.

El río Wainganga recibe numerosos afluentes por ambas orillas y drena las regiones occidental, central y oriental de los distritos de Chandrapur, Gadchiroli, Bhandara, Gondia y Nagpur, del estado de Maharashtra.

Los principales afluentes del río Wainganga son: por la orilla occidental, el río Kathani, que nace en las colinas de Dhanora Pendhri y se une al Wainganga cerca de la ciudad de Gadchiroli; el Potphodi; el Gadhavi; y el río Chandan, un importante río del distrito Balaghat) y Bavanthadi.

Rudyard Kipling utilizó el Wainganga (también llamado Waingunga en las ediciones más antiguas), como un hito fundamental en las historias de Mowgli, en El libro de la selva (The Jungle Book) y en El segundo libro de la selva (The Second Jungle Book) (1894-95).

El valle del Wainganga se halla rodeado por extensiones de bosque caducifolio seco.