El Thouet fluye entonces en un valle poco encajado según una traza caracterizada por los pequeños meandros cuya existencia está ligada al bajo caudal del arroyo.

El Thouet comienza a encajarse unos 25 m en los granitoides hercinianos, pero este material, que resiste bien la erosión de una corriente en sus orillas, impide que el río ensanche su lecho estrecho.

[6]​ Desde Saint-Loup-Lamairé hasta Thouars, penetrando en los terrenos calizos del Jurásico Inferior y Medio, el Thouet fluye en un valle abierto y profundo de una cincuentena de metros.

Su valle, corresponde a una depresión de 1 a 2 km de ancho, no está marcado, no encajándose más que dos veces: en Montreuil-Bellay y en su última carrera entre Varrains y su confluencia con el Loira (donde se encuentran verdaderos acantilados formados de cretas y calizas creto-arcillosas o tuffeau).

[3]​ Contrariamente a otros ríos, el Thouet no tiene una cuenca estructurada, sus diversos afluentes ofrecen una organización irregular, ya que el sustrato, muy heterogéneo, no ha contribuido a la homogeneidad de la red hidrográfica.

[10]​ Esta última tiene la particularidad de ser mucho más densa en la margen izquierda donde se originaron muchos afluentes en el Gâtine poitevina que en la margen derecha, donde los únicos afluentes significativos (especialmente el Dive) vienen a alimentar el río en la última parte de su curso.

[11]​ Por lo tanto, es difícil proporcionar datos precisos sobre la cuenca, excepto en términos puramente geográficos.

[5]​ Las ciudades son raras y pequeñas (salvo Saumur, con cerca de 30 000 hab.,aunque es principalmente una ciudad del Loira): Bressuire (18 000 hab.

Las precipitaciones relativamente regulares, por otro lado, no presentan la misma homogeneidad, con un declive en el gradiente suroeste/noreste.

Por otro lado, la parte aguas abajo y la región drenada por el Dive hacia el este, están mucho menos regadas, la lluvia cae a 700 mm, o incluso menos en Saint-Martin-de-Mâcon (506 mm).

Este caudal tiene variaciones anuales muy fuertes con un período concentrado de aguas altas en invierno (respectivamente 41,7 m³/s en enero, 49,7 m³/s en febrero y 32,2 m³/s en marzo) y aguas bajas especialmente pronunciadas durante el período estival: 3,99 m³/s en julio, 2,98 m³/s en agosto, 3,07 m³/s en septiembre.

Se explica por la naturaleza de las rocas que favorece un caudal brutal e inmediato de precipitaciones combinado con la evapotranspiración más fuerte en verano que durante el invierno.

Es posible que los barcos ya estuvieran transportando mercancías en el río antes de esa fecha, transfiriendo la carga, utilizando grúas, entre diferentes embarcaciones al pasar cada obstáculo.

Los acondicionamientos se hicieron, sin saber la fecha exacta de la puesta en marcha, pero en 1435, se trató de las reparaciones que debían hacerse en los «portineaux au-dessus des grandes portes» [portineaux sobre las puertas grandes], lo que pueden ser interpretado como «pertuis en amont des portes marinières principales» [pertuis aguas arriba de las puertas marineras principales].

Un proyecto para hacer el río navegable hasta Thouars se propuso en 1746, pero sigue siendo letra muerta.

Pero era demasiado tarde porque el comercio fluvial pronto estaría condenado ante la competencia tanto las rutas carreteras, vueltas más carretables, y sobre todo de la llegada ferrocarril, que apareció en la región en 1874.