El Logmozero drena en el lago Onega mediante varios canales y conductos.
La ciudad más importante próxima al río es Petrozavodsk (con un población estimada en 2010 de 270.601 habitantes), localizada en la orilla izquierda del lago Onega, próxima a la desembocadura del Shuya.
El río Shuya se congela de noviembre a enero y está bloqueado por el hielo hasta abril-primera quincena de mayo.
Sus principales afluentes son los ríos Chalna (Чална), Wilga (Вилга), Kutizhma (Кутижма), Svyatreka (Святрека), Syapsya (Сяпся), Nyalma (Няльма), Suoyoki (Суойоки) y Tarasyoki (Тарасйоки).
En el río se han construido varias pequeñas centrales hidroeléctricas, propiedad de Hidro Karelia.