[2]​ En 1612; por la situación alarmante, el Justicia Mayor trasladó la población hacia donde actualmente está la plaza Zaragoza.

En el siglo XIX, las fuerzas del agua del río Santa Catarina alimentó las antiguas industrias de los molinos Jesús María, la Fama, la Leona, el Blanqueo y la Sombrerería Universal, iniciando así la industrialización de la zona metropolitana y abasteció el agua necesaria para los procesos de industrialización.

Fue tal la destrucción que los testimonios pueden verse en el libro “El río fiera, bramaba” de Osvaldo Sánchez y Alfonso Zaragoza, publicado en 1989, y otro publicado por don Humberto Buentello Chapa.

Siendo gobernador Ignacio Morones Prieto, se iniciaron las obras de canalización del río en 1953.

También durante esta administración se inició la construcción de la cortina Rompepicos en una garganta del río entre la Sierra Agua del Toro y el Cerro El Magueyal, en el municipio de Santa Catarina para contener las crecidas del río en caso de tormenta, obra que en su momento fue criticada por su costo e impacto ambiental.

[11]​ Después del huracán, no se volvieron a construir instalaciones deportivas o comerciales en el lecho del río, lo que permitió que el ecosistema se recuperara.

Las comunidades vegetales dotan de hábitat y corredor biológico para la fauna silvestre que se desarrolla en ellas.

En cuanto al estrato bajo, es decir herbáceas se han avistado 25 familias, las cuales pertenecen a 53 géneros y 60 especies.