En la parte más próxima a la embocadura con el lago Titicaca, formando la laguna Aguallamaya de 96 km², hay un primer y corto tramo de 14 km que forma la frontera natural entre el Perú y Bolivia.En sus márgenes, en territorio boliviano, sus aguas son utilizadas para el riego, a pesar del alto contenido en sales minerales.Como resultado de este esfuerzo internacional se han ejecutado las siguientes acciones: El lago Titicaca no es la única fuente del río Desaguadero.Así, en su nacimiento, puede tener incluso un caudal nulo o negativo, que significa una inversión del curso superior.Estas, por lo demás, sufren una primera laminación en la Laguna de Aguallamaya, situada inmediatamente aguas abajo del puente.Sin embargo esta posibilidad puede ser controlada desde que se han construido las compuertas en proximidad con el Puente Internacional.
