Con un caudal considerablemente aumentado por el afluente, el Alcántara se dirige hacia el este, prácticamente formando un ángulo recto —hay que tener en cuenta que en los mapas el río principal parece ser el Flascio y no el Alcántara, el ángulo de confluencia es muy claro—.

A partir del municipio de Mojo Alcantara, el río comienza a fluir en su mayor parte bancarizado, tocando los centros de Francavilla di Sicilia y Castiglione di Sicilia.

La desembocadura se encuentra en el mar Jónico y precisamente en la zona de San Marco.

Entre los municipios atravesados se encuentran: Floresta, Santa Domenica Vittoria, Randazzo, Mojo Alcantara, Castiglione di Sicilia, Francavilla di Sicilia, Motta Camastra, Graniti, Gaggi, Calatabiano, Taormina y Giardini-Naxos.

En cualquier caso, no faltan inundaciones excepcionales debidas a lluvias insistentes, como ocurrió en diciembre de 2003, durante las cuales el Alcántara puede mostrar una fuerza impresionante, especialmente en el tramo de barrancos.