[1]​ El origen del río Águeda es el manantial del Puente de los Llanos, en Navasfrías (Salamanca), entre los cerros "Las Mesas" y "Peñas Gordas".

Es la frontera natural entre España y Portugal durante 40 kilómetros y desemboca en el Duero por su margen izquierda cerca de Barca de Alba, en la zona internacional fronteriza con Portugal.

En la desembocadura del río Águeda se encuentra el muelle nuevo de Vega Terrón.

El río Duero entra completamente en territorio portugués justo en esa desembocadura.

Aparece descrito en el primer volumen del Diccionario geográfico-estadístico-histórico de España y sus posesiones de Ultramar de Pascual Madoz con las siguientes palabras:[2]​ La Confederación Hidrográfica del Duero estableció para el río Águeda los siguientes caudales mínimos de mantenimiento (o caudales ecológicos y caudales ambientales) para el período 2006/07: Los afluentes del Águeda presentan un corto recorrido y se ven afectados por un fuerte estiaje, llegando incluso a secarse durante el verano.