Profago

Este ADN podrá mantenerse así durante varias generaciones (tiempo durante el que la célula hospedadora será inmune a infecciones del mismo virus) hasta que se induzca su separación del ADN celular, momento en el comenzará un ciclo lítico.[2]​ Sin embargo, se han propuesto otros mecanismos alternativos que también podrían participar el la decisión lisis-lisogenia, como la liberación de un péptido señal para establecer el ciclo lisogénico.Aunque rara vez ocurre, los cultivos de bacterias lisogénicas siempre presentan fagos libres, como resultado del proceso llamado "inducción espontánea".[2]​.Los factores intrínsecos son aquellos relacionados con el entorno interno de la célula, por ejemplo, durante el crecimiento, se ha demostrado que la replicación continua (multifork) causa daños esporádicos en el ADN, lo que resulta en la desrepresión de los genes SOS e incluso las especies reactivas de oxígeno (ROS) provocan daños en el ADN que conduce a la inducción del profago.Por ejemplo, ROS, radiación UV, pH, calor o antibióticos como la mitomicina C. Todos estos agentes pueden alterar el ADN, detener la síntesis y la división celular, lo que lleva a la acumulación de ssDNA, activación y respuesta de emergencia.