La Primera División de la República Federal de Yugoslavia en su temporada 1999/2000, fue la 8° edición del torneo, en esta participaron clubes de la actual Serbia y de Montenegro, el campeón fue el club Estrella Roja de Belgrado que consiguió su 21° título en su historia, logró además el doblete al vencer en la final de la copa al club Napredak Krusevac.
Los mejores veintidós clubes del país participaron en la competición y se agrupan en un único grupo en que se enfrentan dos veces a sus oponentes.
Al final de la temporada para permitir el paso de la primera división de 22 a 18 clubes, los seis últimos de la clasificación son relegados y sustituidos por los dos mejores clubes de la Segunda Liga.
Antes del inicio de la temporada, el club KF Prishtina abandonó la competencia para pasar a integrar la Superliga de Kosovo.