El torneo se desarrolló a partidos de visita recíproca por lo que cada club jugó 26 partidos, al final de este el Club Deportivo Guadalajara se convirtió en campeón por tercera vez en su historia superando por 4 puntos al América.

Los catorce participantes disputan el campeonato bajo un sistema de liga, es decir, todos contra todos a visita recíproca; con un criterio de puntuación que otorga dos unidades por victoria, una por empate y cero por derrota.

[1]​ En la temporada 1959-1960 jugaron 14 equipos que se distribuían de la siguiente forma:

Fuente: RSSSFEl Club Deportivo Zamora, dirigido por Carlos Seville, desciende después de estar 3 temporadas consecutivas en primera división, siendo esta su cuarta y última temporada en el máximo circuito.

Dejó su lugar a los Rayados del Club de Fútbol Monterrey que ascendieron a primera tras coronarse campeón de la segunda división por segunda vez en su historia.