Selby es conocido por su Illustrations of British Ornithology (1821–1834), el primer conjunto de ilustraciones sobre la vida de las aves británicas.
Y también escribió Illustrations of Ornithology con William Jardine y A History of British Forest-trees (1842).
Se casó con Lewis Tabitha Mitford, y tuvieron tres hijas.
Falleció en Twizell House, siendo sepultado en el Cementerio de Bamburgh.
La abreviatura Selby se emplea para indicar a Prideaux John Selby como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.