El poder ejecutivo está organizado en un conjunto de diversas instituciones que forman la Administración Pública Federal.
A su vez, esta última está clasificada en dos grandes grupos con características y propósitos bien diferenciados: En el primer grupo están las dependencias de la administración centralizada, que se integra por 17 secretarías de Estado y la Consejería Jurídica del Ejecutivo Federal, cuyas atribuciones están consignadas en la Ley Orgánica de la Administración Pública Federal.
Por su parte, la Fiscalía General de la República tiene autonomía, pues se rige por su propia ley orgánica ( su titular debe ser ratificado por el Congreso).
En este primer grupo se incluyen también 69 órganos desconcentrados, constituidos para el cumplimiento de tareas específicas y que jurídica y administrativamente forman parte de las secretarías de Estado y de la PGR.
Para los efectos de la programación, coordinación y conducción, las dependencias de la administración central agrupan por sectores a las entidades paraestatales con las que tienen mayor afinidad en cuanto a funciones.