Uno de los principales cambios que introdujo el Porche 996 en su época era el motor refrigerado por agua, el cual dejaba atrás a los motores refrigerados por aire y supondría un gran cambio en la fabricación de automóviles posteriores.Cuenta con tracción trasera y con una transmisión manual de seis velocidades.Cuenta con un Boxer de 3,4 litros refrigerado por agua, el cual se ubica en la parte trasera del coche y denominado M96, que ofrece 300 CV.Esta forma de sus faros levantaron gran polémica, debido a que los puristas achacaban que eran muy semejantes a los faros del recién nacido Porsche Boxster.Por esta razón, se le dio un lavado de cara al Porsche 996 cambiando la forma de los faros (los cuales seguían sin ser redondos), respondiendo así a las críticas.
