ADN polimerasa

Los dNTP que se usan en la replicación del ADN contienen tres fosfatos unidos al grupo hidroxilo 5' de la desoxirribosa y dependiendo de la base nitrogenada serán dATP, dTTP, dCTP o dGTP.El ataque nucleofílico se produce sobre el fosfato α (el más próximo a la desoxirribosa) del desoxirribonucleósido 5' trifosfato que entra, liberándose pirofosfato inorgánico y alargándose el ADN (al formarse un nuevo enlace fosfodiéster).Esto provoca que el alargamiento de la cadena en formación se realice en la dirección 5'-3 '.Ninguna ADN polimerasa conocida puede iniciar una hebra de ADN nuevamente, es decir, no puede colocar el primer nucleótido en la hebra, luego de unir el segundo, luego el tercero, y así sucesivamente.Otra propiedad que tienen algunas ADN polimerasas, pero no todas, es la corrección de errores.Este proceso corrige los errores producidos durante la formación del ADN neosintetizado.Las estructuras conservadas generalmente realizan funciones importantes e insustituibles en la célula, cuyo mantenimiento produce una serie de ventajas.Las estructuras conservadas suelen indicar funciones importantes e insustituibles de la célula, cuyo mantenimiento proporciona ventajas evolutivas.La forma se puede describir como una mano derecha con dominios de pulgar, dedo y palma.La rápida catálisis de la ADN polimerasa se debe a su naturaleza procesiva.La ADN polimerasa promedio requiere aproximadamente un segundo para localizar y unir una unión cebador / molde.[11]​ La transcripción de Pol V a través de los genes umuDC está altamente regulada para producir solo Pol V cuando el ADN dañado está presente en la célula y genera una respuesta SOS.Un ejemplo es la derivación del entrecruzamiento de guanina timina intracatenaria donde se demostró, basándose en la diferencia en las firmas mutacionales de las dos polimerasas, que pol IV y pol V compiten por TLS del entrecruzamiento intracatenario.[14]​ El complejo PolD es un heterodímero de dos cadenas, cada una codificada por DP1 (corrección pequeña) y DP2 (catalítico grande).Su dominio HSH N-terminal es similar a las proteínas AAA, especialmente la subunidad δ y RuvB de Pol III , en estructura.Esta nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una amplificación típica por PCR.El cambio de plantilla (recombinación) parece ser necesario para mantener la integridad del genoma y como un mecanismo de reparación para salvar los genomas dañados Hay varios tipos de ADN polimerasa en los eucariotas: son las Pol ζ, α, δ, γ, θ, ν, ε, β, σ, λ, μ, ι, κ, η, TDT y la RT.Un motivo está ubicado en el dominio de 8 kDa que interactúa con el ADN corriente abajo y un motivo está ubicado en el dominio del pulgar que interactúa con la cadena del cebador.TdT se expresa solo en tejido linfoide y añade "n nucleótidos" a las roturas de doble hebra formadas durante la recombinación V (D) J para promover la diversidad inmunológica.Pol ε tiene un dominio "palma" más grande que proporciona alta procesividad independientemente del PCNA.El sitio activo, sin embargo, difiere entre los miembros de la familia debido a las diferentes lesiones que se reparan.La funcionalidad de Pol κ no se comprende completamente, pero los investigadores han encontrado dos funciones probables.Se cree que Pol κ actúa como un extensor o un insertador de una base específica en ciertas lesiones del ADN.Pol ζ carece de actividad exonucleasa 3 'a 5', es único porque puede extender cebadores con desajustes terminales.Durante mucho tiempo se pensó que Pol γ, codificada por el gen POLG era la única polimerasa mitocondrial.Sin embargo, investigaciones recientes muestran que al menos Pol β (beta) , una polimerasa de la Familia X, también está presente en las mitocondrias.La subunidad accesoria se une al ADN y es necesaria para la procesividad de Pol γ.Pol ν (nu) se considera la menos eficaz de las enzimas polimerasas.Sin embargo, la ADN polimerasa nu juega un papel activo en la reparación de la homología durante las respuestas celulares a los enlaces cruzados, cumpliendo su función en un complejo con helicasa.Esta nueva plantilla de ADN se puede utilizar para una amplificación típica por PCR.