En 1874 se vio forzado al exilio, pero regresó a Haití unos años más tarde, bajo la presidencia de Pierre Théoma Boisrond-Canal.
El nuevo presidente, Florvil Hyppolite, le concedió un puesto militar importante en el norte.
[2] Posteriormente se unió a Joseph Anténor Firmin en su marcha sobre Port-au-Prince en su intento de tomar el poder.
Alexis se mantuvo en el poder durante seis años, a pesar de que su régimen continuó haciendo frente a rebeliones, y las frecuentes acusaciones de corrupción hacia su gobierno.
Alexis fue derrocado el 2 de diciembre, tras lo que partió al exilio en Jamaica[5] y más tarde en Nueva Orleans (EE. UU.)