Fue ordenado sacerdote en 1977, y en 1998 fue nombrado obispo de Moulins.
Barbarin se licenció en Filosofía en la Universidad de París-Sorbona (París IV).
Tiene un doctorado en teología por el Instituto Católico de París.
En febrero de 2019, fue condenado en primera instancia a seis meses de prisión en libertad condicional por haber encubierto los abusos sexuales del padre Bernard Preynat a un grupo de scouts.
Barbarin fue considerado papable en el cónclave de 2013, en el que finalmente salió elegido el cardenal Jorge Mario Bergoglio, que pasó a ser el papa Francisco.