[1] Jugó un año fútbol universitario en Kean College, ganando con el primer equipo All-NJAC con honores en 1995, antes de convertirse en profesional.
Tres años en las menores siguieron, hasta que los Metros preparó a Villegas en la primera ronda del Draft Complementario de la MLS 1999.
En el momento de la operación, Villegas había comenzado jugando siete encuentros con MetroStars en esa temporada.
Villegas dejó la MLS después, volvió a su Ecuador natal para jugar con Aucas, Barcelona SC, Manta y Deportivo Cuenca.
Se trasladó de nuevo a los Islanders en la North American Soccer League en junio.