Fue nombrado matemático del emperador Carlos V, a quien había dedicado una de las obras que más fama le dieron, el Astronomicum Cæsareum.Aquí publicó en 1520 una versión personal del planisferio de Waldseemüller con el título Tipus Orbis Universalis.La peste de 1521 le obligó a dejar la ciudad, trasladándose a Ratisbona primero y a Landshut más tarde, donde en 1524 publicó la obra que más fama le daría, el Cosmographicus liber Petri Apiani mathematici studiose collectus, conocida simplemente como la Cosmographia de Petrus Apianus, varias veces reimpresa y traducida a catorce idiomas antes de concluir el siglo.El mismo año de su llegada a Ingolstadt publicó un libro de gramática en lengua vernácula, Ein newe und wolgegründete underweisung aller Kauffmanns Rechnung (Un libro nuevo y fiable para aprender el cálculo y destinado a los comerciantes), para hacer su estudio asequible a un público más amplio.En este sentido, fue el primero en valerse de cristales ahumados para la observación del Sol.