Fue elegido diputado en 2002, pasando a ocupar varios ministerios en el gobierno de Somare hasta 2004.

[2]​ En 2004 pasó a liderar la oposición aunque tres años después volvió al gobierno de Samore como ministro del Servicio Público.

[3]​ En 2011 Somare dejó el cargo por enfermedad pero O'Neill siguió ocupando un ministerio en el gobierno interino de Sam Abal.

El 2 de agosto el parlamento le eligió nuevo primer ministro por 70 votos a favor por 24 en contra en una votación organizada por sorpresa por la oposición.

[10]​ En 2014 desmanteló un grupo policial contra la corrupción que lo había acusado de malversación de fondos, nombrando una nueva cúpula policial que dejó el caso en suspenso.