Era hijo de Anna Wolff y Otto Wegener.
A los veinte años, ya interesado por la poesía y el teatro, ingresó en la Universidad de Leipzig para seguir la carrera de Derecho.
En 1905 abandonó la carrera para unirse a la compañía teatral de Max Reinhardt.
Es uno de los realizadores más destacados del expresionismo alemán, recordado especialmente por sus películas sobre el Golem, basadas en la novela de Gustav Meyrink.
Fue considerada como la versión definitiva Der Golem, wie er in die Welt kam (1920), que dirigió, y en la que actuó junto a Carl Boese.